پس از آغاز دوران حرفه‌ای خود در باشگاه فرانسوی آرل، اسماعیل بن ناصر در ژوئیه ۲۰۱۵ با آرسنال قرارداد بست. او نخستین بازی بزرگسالان خود برای آرسنال را در ۲۷ اکتبر ۲۰۱۵ در دور چهارم جام اتحادیه و در بازی خارج از خانه مقابل شفیلد ونزدی انجام داد؛ جایی که در دقیقه ۱۹ جایگزین تئو والکات شد—والکات خود پیش‌تر جایگزین چمبرلینِ مصدوم شده بود—و این دیدار در نهایت با شکست ۳-۰ به پایان رسید.
در ۳۱ ژانویه ۲۰۱۷، اعلام شد که بن ناصر برای باقی‌ماندهٔ فصل ۲۰۱۶/۱۷ به‌صورت قرضی به تیم تور در لیگ ۲ فرانسه خواهد پیوست.
در ۲۱ اوت ۲۰۱۷، بن ناصر به امپولی پیوست.
دوران بازیگری: آرلس فرانسه - آرسنال - تور فرانسه - امپولی - میلان - مارسی - دینامو زاگرب - الغرافه قطر
تعداد بازی برای تیم اصلی آرسنال: ۱
تعداد بازی برای تیم‌های پایه آرسنال: ۳۲
اگرچه او پیش از آن در رده‌های پایه برای فرانسه بازی کرده بود، در ۳۱ ژوئیه ۲۰۱۶ فدراسیون فوتبال الجزائر اعلام کرد که بن ناصر تصمیم گرفته است تابعیت ورزشی خود را تغییر دهد و در سطح بین‌المللی برای الجزائر به میدان برود. او نخستین بازی خود را برای تیم ملی الجزائر در مقدماتی جام ملت‌های آفریقا ۲۰۱۷ و در پیروزی ۶-۰ مقابل لسوتو انجام داد. بن ناصر در ۱۱ ژانویه ۲۰۱۷ برای حضور در جام ملت‌های آفریقا ۲۰۱۷ به تیم ملی الجزائر فراخوانده شد تا جایگزین سفیر تایدر شود که در تمرینات دچار مصدومیت شده بود.
در جام ملت‌های آفریقا ۲۰۱۹، بن ناصر به الجزائر کمک کرد تا پس از ۲۹ سال به نخستین عنوان قهرمانی خود دست یابد. او مسابقات را با ثبت سه پاس گل—مشترکاً با فرانک کسیه—به‌عنوان برترین پاسور گل رقابت‌ها به پایان رساند؛ از جمله پاس گلی که به بغداد بونجاح داد و منجر به گل پیروزی‌بخش مقابل سنگال در فینال ۱۹ ژوئیه شد. او بعداً هم به‌عنوان بهترین بازیکن جوان و هم بهترین بازیکن تورنمنت انتخاب شد.
در دسامبر ۲۰۲۳، نام او در فهرست تیم ملی الجزائر برای جام ملت‌های آفریقا ۲۰۲۳ قرار گرفت.