در ۱۳ ژوئن ۲۰۲۲، مارکینیوش با قراردادی بلندمدت به آرسنال پیوست.
او پس از حضور در پیشفصل، برخلاف انتظارات از نظر آمادگی جسمانی در وضعیت بسیار خوبی قرار داشت.
در نخستین بازی اروپایی خود برای تیم زیر ۲۱ سال مقابل منچستر یونایتد، او با ثبت یک گل و یک پاس گل و ارائهای قدرتمند، استعداد خود را به رخ کشید.
او همچنین مقابل تیم زیر ۲۱ سال وستهام موفق به ثبت دابل (دو گل) شد؛ لازم به ذکر است که او در ۲ بازی روی هر ۵ گل تیمش نقش مستقیم داشت. از آنجا که او فرمی فراتر از انتظار نشان میداد، مشخص شد که دیگر در سطح تیمهای پایه نیست و به زودی فرصت بازی در تیم اصلی به او داده خواهد شد.
پیش از بازی هفته چهارم مقابل فولام، وقتی زینچنکو و پارتی به دلیل مصدومیت از ترکیب اصلی کنار گذاشته شدند، او برای اولین بار در این فصل در لیست ذخیرهها قرار گرفت. با این حال، به دلیل برتری شکننده ۲-۱، تیم فرصتی برای بازی دادن به نیروهای جدید نداشت و اولین بازی او به زمان دیگری موکول شد.
او نخستین بازی خود برای آرسنال را به عنوان بازیکن فیکس در دور رفت لیگ اروپا مقابل افسی زوریخ انجام داد. در دقیقه ۱۷، ادی انکتیا با توپ به سمت چپ حرکت کرد و آن را برای مارکینیوس فرستاد؛ او نیز بدون مکث و با پای راست توپ را روی همان خط وارد دروازه کرد تا نخستین گل خود را پس از انتقال به آرسنال و در اولین بازی اروپاییاش به ثمر برساند. در دقیقه ۶۲، او با ارسال پاس گل با ضربه سر برای انکتیا، باعث کامبک و پیش افتادن تیم شد و نمایشی در حد بهترین بازیکن زمین ارائه داد و در دقیقه ۶۹ جای خود را به بوکایو ساکا داد. او روی هر دو گل تیم نقش مستقیم داشت و کلید اصلی پیروزی ۲-۱ آرسنال بود. در زمان انتقال، او صرفاً یک استعداد با پتانسیل به نظر میرسید، اما از همان بازی نخست، همه را مقابل مدافع عنوان قهرمانی سوپر لیگ سوئیس شگفتزده کرد تا لبخند را بر لب هواداران و باشگاهی که در آن پنجره موفق به جذب وینگر نشده بود بنشاند. به لطف این عملکرد، او به عنوان بهترین بازیکن زمین انتخاب شد و گمانهزنیها درباره صلاحیت او به عنوان جانشین بوکایو ساکا افزایش یافت. به نظر میرسید در ادامه فصل در لیگ بیشتر از او استفاده خواهد شد.
پس از آن، نام او در میان ۴۰ کاندیدای نهایی جایزه پسر طلایی (Golden Boy) سال ۲۰۲۲ قرار گرفت.
سپس در هفته هشتم مقابل برنتفورد به عنوان بازیکن تعویضی وارد زمین شد و اگرچه کمتر از ۵ دقیقه بازی کرد، اما نخستین بازی خود در لیگ برتر را به ثبت رساند.
در بازی هفته سوم لیگ اروپا مقابل بودو گلیمت، او با خودخواهی بازی کرد و پاسهای نادرست زیادی داشت. با توجه به شکست ۵-۱ زوریخ مقابل پیاسوی و ضعف شدید حریف، این عملکرد خیلی به چشم نیامد، اما نشان داد که او همچنان بازیکنی است که نیاز به پیشرفت و توسعه بیشتر دارد.
در هفته چهارم لیگ اروپا، او در بازی رفت مقابل بودو در دقیقه ۵۹ جایگزین ساکا شد، اما حتی با در نظر گرفتن چمن مصنوعی چالشبرانگیز مسابقه، نمایش خوبی ارائه نداد. اینکه عملکرد خوب او فقط مقابل زوریخِ ضعیف بوده یا خیر، قرار بود در بازی مقابل پیاسوی مشخص شود.
با این حال، او در سه بازی باقیمانده، از بازی دوم مقابل پیاسوی در لیگ اروپا تا دیدار هفته ششم مقابل زوریخ، به میدان نرفت. پس از آن در دور ۱/۳۲ نهایی جام اتحادیه مقابل برایتون بازی کرد، اما بدون موفقیت خاصی تعویض شد.
در واقع مشخص شد که حضور در سطح تیم اصلی آرسنال برای او دشوار است، اما از طرفی بازی در تیم زیر ۲۱ سال نیز برایش بسیار ساده بود؛ بنابراین با انتقال ویرا به پست پشتیبان بال راست و جذب تروسار به عنوان نیروی چرخشی بال چپ، احتمال خروج قرضی او بسیار بالا رفت.
وی در ادامه دورانش در آرسنال، به نوریچ، نانت، فلومیننزه و کروزیرو قرض داده شد و در نهایت در سال ۲۰۲۵ به طور دائمی به کروزیرو پیوست.