توماس بلک دوران حرفه‌ای خود را به عنوان کارآموز در آرسنال آغاز کرد، جایی که در کنار برادر بزرگترش مایکل بازی می‌کرد. او از بازیکنان ثابت تیم قهرمان آرسنال در لیگ برتر جوانان فوتسال/فوتبال در سال ۱۹۹۸ بود و بعداً دو بار به صورت قرضی به مدت یک ماه به کارلایل یونایتد و یک ماه به بریستول سیتی فرستاده شد. او تنها دو بار برای تیم اصلی آرسنال به میدان رفت؛ یک بار در جام اتحادیه در برابر میدلزبورو در ۳۰ نوامبر ۱۹۹۹ که آرسنال در ضربات پنالتی شکست خورد، و دیگری در لیگ برتر در پیروزی ۱-۰ مقابل اورتون در ۲۹ آوریل ۲۰۰۰.
بلک که نتوانست به تیم اصلی آرسنال راه یابد، در ژوئیه ۲۰۰۰ با مبلغ ۵۰۰,۰۰۰ پوند به کریستال پالاس پیوست.