باشگاه فوتبال دینامو زاگرب در ۲۶ آوریل ۱۹۱۱ به عنوان "I. hrvatski gradjanski športski klub" تأسیس شد که به معنای "اولین باشگاه ورزشی شهروندان کرواسی" یا به سادگی "Gradjanski" یا "شهروندان" است. بنابراین، پیشوند باشگاه از NK (FC) به GNK (باشگاه فوتبال شهروندان) تغییر یافت که حرف G نماد ریشههای باشگاه با نام باستانی Gradjanski است. این پیشوند جدید قبل از مجمع عمومی سالانه باشگاه در آستانه جشن صدمین سالگرد اضافه شد.
در سال ۱۹۴۵، باشگاه به دلیل دلایل سیاسی مجبور به تغییر نام و ساختار خود شد و نام جدید دینامو را پذیرفت. در تابستان ۱۹۹۱، نام به HAŠK Gradjanski تغییر یافت که تنها یک سال و نیم دوام آورد و سپس به NK Croatia تغییر نام داد. محبوبترین و دوستداشتنیترین نام دینامو در روز ولنتاین سال ۲۰۰۰ بازگردانده شد.
بر اساس تعداد جامهای کسب شده، GNK دینامو زاگرب موفقترین باشگاه فوتبال کرواسی است که ۳۳ عنوان قهرمانی داخلی را کسب کرده است، که ۲۳ مورد از این ۳۳ عنوان در قهرمانی ملی کرواسی که از استقلال کرواسی در سال ۱۹۹۱ آغاز شد، کسب شده است.
در سال ۱۹۶۷، GNK دینامو زاگرب به مهمترین جام تاریخ خود دست یافت: جام بینشهری، سلف جام یوفا و لیگ اروپا کنونی. آنها در فینال لیدز یونایتد را شکست دادند. در سال ۱۹۶۳، آبیپوشان در فینال مقابل والنسیا شکست خوردند.
GNK دینامو زاگرب موفق شد در ۱۶ فصل گذشته در مراحل گروهی رقابتهای یوفا حضور داشته باشد که ۷ فصل در لیگ قهرمانان اروپا و ۱۰ فصل در جام یوفا/لیگ اروپا بوده است و هنوز مشخص نیست که در فصل ۲۰۲۲/۲۰۲۳ در کدام رقابت شرکت خواهد کرد.
این باشگاه همچنین عملکرد چشمگیری در رقابتهای یوفا داشته است و در ۱۵ فصل گذشته از ۱۶ فصل به مرحله گروهی راه یافته است. در لیگ اروپا ۲۰۱۸/۲۰۱۹، آنها به مرحله یکشانزدهم نهایی رسیدند و تنها در وقت اضافه بازی برگشت در لیسبون مقابل بنفیکا شکست خوردند.
در فصل بعد، GNK دینامو به مرحله گروهی لیگ قهرمانان اروپا راه یافت و به سختی از صعود به مرحله حذفی بازماند. در فصل ۲۰۲۰/۲۰۲۱، ما در لیگ اروپا به عنوان صدرنشین گروه ظاهر شدیم و به مرحله یکچهارم نهایی رسیدیم و به پیروزی به یاد ماندنی مقابل تاتنهام هاتسپر در مرحله یکشانزدهم نهایی دست یافتیم. پس از شکست ۲-۰ در بازی رفت در لندن، GNK دینامو با پیروزی خیرهکننده ۳-۰ در زاگرب، جایی که میسلاو اورشیچ هتتریک فوقالعادهای به ثمر رساند، بازگشت باشکوهی داشت. آبیپوشان در مرحله یکچهارم نهایی توسط ویارئال اسپانیا متوقف شدند.
فصل بعد، باشگاه زاگرب نیز به مرحله حذفی لیگ اروپا راه یافت و با شکست مقابل سویا FC حذف شد. دینامو بازی برگشت را با نتیجه ۱-۰ برد، اما این کافی نبود تا پس از برتری ۳-۱ تیم اسپانیایی در بازی رفت، به دور بعد صعود کند.
علاوه بر این، GNK دینامو زاگرب رکورددار جهانی در تاریخ فینالهای جام جهانی است. هیچ باشگاهی در جهان در تاریخ فینالهای جام جهانی بازیکن بیشتری از آکادمی جوانان خود تولید نکرده است. در جام جهانی ۲۰۱۸ در روسیه، که تیم ملی کرواسی به مدال نقره رسید، ۱۴ بازیکن سابق یا فعلی GNK دینامو زاگرب حضور داشتند. ده نفر از این ۱۴ نفر طبق قوانین "بازیکن پرورشیافته" یوفا از آکادمی جوانان باشگاه پرورش یافته بودند.
حدود یک ماه پس از تأسیس، Gradjanski اولین بازی رسمی خود را انجام داد، به زودی اولین پیروزی را کسب کرد و در سال ۱۹۲۳ اولین عنوان ملی را به دست آورد. این باشگاه که در آن زمان Gradjanski نام داشت، موفقترین باشگاه یوگسلاوی بین دو جنگ جهانی بود و پنج قهرمانی را به دست آورد، قبل از اینکه دولت جدید آن را در ۹ ژوئن ۱۹۴۵ به دینامو تغییر نام دهد و مدیریت جدید وفادار به رژیم کمونیستی را نصب کند. اگرچه دولت جدید سعی کرد دینامو را به عنوان یک باشگاه جدید معرفی کند، اما نتوانست هویت یکسان Gradjanski و دینامو را پنهان کند. نه تنها باشگاه روحیه شهری متمایز زاگرب خود را حفظ کرد، بلکه رنگ آبی، ویژگیهای اساسی نشان باشگاه، مربیان، فیزیوتراپیستها، اکثر بازیکنان سابق و همان پایه هواداری را نیز حفظ کرد. در نتیجه، دینامو و Gradjanski یک باشگاه واحد هستند که به دلیل شرایط تاریخی چندین بار نام و وضعیت قانونی خود را تغییر دادند.
دینامو مسیر Gradjanski را ادامه داد و بلافاصله به عضویت "چهار بزرگ" دولت درآمد، همراه با هایدوک اسپلیت، ستاره سرخ و پارتیزان بلگراد. این باشگاه در مسابقات داخلی نتایج خوبی کسب کرد و همچنین در دهه ۱۹۶۰ نتایج چشمگیری در اروپا کسب کرد. نیمهنهایی جام برندگان جام در سال ۱۹۶۱، فینال جام بینشهری (امروز لیگ اروپا) در سال ۱۹۶۳ و در نهایت، کسب این جام معتبر در سال ۱۹۶۷. از پایان جنگ جهانی دوم تا فروپاشی جمهوری فدرال یوگسلاوی در سال ۱۹۹۱، پسران آبی از زاگرب چهار عنوان قهرمانی لیگ و هفت جام را جمعآوری کردند.
از زمان استقلال کرواسی در سال ۱۹۹۱، دینامو به باشگاه پیشرو در کشور، موفقترین باشگاه در منطقه سابق یوگسلاوی و یکی از قدرتمندترین باشگاههای اروپای جنوب شرقی تبدیل شده است. این باشگاه با نام FC Croatia، پنج قهرمانی و چهار جام در دهه ۱۹۹۰ کسب کرد و پس از بازگشت نام قدیمی دینامو در فوریه ۲۰۰۰، این موفقیت را ادامه داد. دینامو امروز ۲۳ عنوان قهرمانی لیگ در کرواسی با ۱۱ عنوان پیاپی دارد. این روند توسط NK رییکا که در سال ۲۰۱۷ جام را به دست آورد، قطع شد و پس از آن دینامو به پنج عنوان پیاپی دیگر دست یافت.
این باشگاه از زاگرب همچنین به یک سری نتایج برجسته در صحنه بینالمللی دست یافت، یکی از معدود باشگاههایی که موفق شد غولهای فوتبال جهان را در بازیهای خارج از خانه شکست دهد:
بارسلونا (۱-۰ در ۱۹۲۳)، رئال مادرید (۴-۳ در ۱۹۷۴)، بایرن مونیخ (۴-۱ در ۱۹۶۳)، اینتراخت فرانکفورت (۷-۱ در ۱۹۲۵)، اینتر میلان (۴-۳ در ۱۹۳۸)، میلان (۲-۱ در ۱۹۸۸)، المپیک مارسی (۶-۰ در ۱۹۴۷)، پاری سن ژرمن (۳-۱ در ۱۹۸۷)، پورتو (۲-۱ در ۱۹۶۲)، سلتیک (۱-۰ در ۱۹۶۷)، گالاتاسرای (۵-۰ در ۱۹۲۴)، گراس هوپر (۵-۰ در ۱۹۹۷)، وستهام یونایتد (۱-۰ در ۲۰۲۱)، آژاکس (۱-۰ در ۱۹۹۸ و ۳-۲ در ۲۰۰۷)، فاینورد (۵-۱ در ۱۹۶۰ و ۲-۰ در ۲۰۲۰)، فرنتسواروش (فقط برای ذکر پیروزی اخیر با نتیجه ۴-۰ در ۲۰۱۹)، آندرلخت (۱-۰ در ۲۰۰۹ و ۲-۰ در ۲۰۱۸)...
آنها همچنین بازیهای به یاد ماندنی انجام دادند و چهار بار مقابل یوونتوس، سه بار مقابل میلان، سه بار مقابل سلتیک، همچنین سه بار مقابل غولهای هلندی آژاکس و فاینورد، پیروزی بزرگ فراموشنشدنی ۵-۱ مقابل لیورپول در سال ۱۹۳۶ یا ۴-۰ مقابل هامبورگ در سال ۱۹۷۰، ۵-۰ مقابل پارتیزان در سال ۱۹۹۷، ۳-۱ مقابل پورتو در سال ۱۹۹۸، ۲-۱ مقابل آرسنال در سال ۲۰۱۵، ۴-۱ مقابل فنرباغچه در ۲۰۱۸، ۴-۰ مقابل آتالانتا در ۲۰۱۹، ۳-۰ مقابل تاتنهام در ۲۰۲۱ و یک تساوی بدون گل به یاد ماندنی دیگر مقابل منچستر یونایتد در اولدترافورد در مرحله گروهی لیگ قهرمانان ۱۹۹۹.
در فصل ۲۰۱۵/۲۰۱۶، دینامو دوباره به مرحله گروهی لیگ قهرمانان اروپا راه یافت. آغاز مرحله گروهی لیگ قهرمانان نتوانست بهتر از این باشد - دینامو در دور اول ۲-۱ مقابل آرسنال

